03 Avr 2023
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Qu’est-ce que le microbiote intestinal ?

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Dans tout le corps humain et en particulier dans le tube digestif, des écosystèmes bactériens travaillent en symbiose avec les organes humains pour assurer l’alimentation, la digestion et de ce fait, la santé et le bien-être global. Chez l’adulte, 95% de ces microbes symbiotiques se trouvent dans les intestins (petit et gros intestin) [1].

Le microbiote est défini comme « l’assemblage de micro-organismes (bactéries, archées, eucaryotes et virus) présents dans un environnement défini » [2]. Ainsi, le microbiote intestinal désigne les micro-organismes situés dans le tractus gastro-intestinal humain.

Le microbiote intestinal ou microbiome intestinal d’un adulte en bonne santé héberge en moyenne 100 000 milliards de micro-organismes, issus d’environ 1000 espèces différentes [3]. Parmi ces micro-organismes, il existe des espèces dominantes qui se retrouvent chez la grande majorité des individus, comme les protéobactéries [4], mais la composition du microbiote intestinal est spécifique à chaque individu et influencée par de nombreux facteurs tels que la génétique, le prise de médicaments, l’environnement de vie, le stress et les habitudes alimentaires [2]. Si certains facteurs comme la génétique et le vieillissement sont difficilement contrôlables, agir sur notre alimentation et notre mode de vie peut contribuer au bon fonctionnement de notre microbiote intestinal.

Le rôle principal du microbiote intestinal réside dans la digestion

En sécrétant certaines enzymes que le corps humain ne synthétise pas naturellement, le microbiote intestinal métabolise certains composants alimentaires, tels que les fibres, qui ne peuvent être digérées dans l’intestin grêle. Lors de la métabolisation des fibres, les bactéries produisent de petits composants précieux appelés acides gras à chaine courte, qui sont beaucoup mieux absorbés par la circulation systémique et sont bénéfiques à d’autres fonctions du corps humain [2].

Microbiote intestinal et système immunitaire

Le microbiote intestinal sain participe à la défense de l’intégrité de l’organisme, en signalant l’intrusion de pathogènes opportunistes et en dégradant les composants toxiques et les allergènes [2]. 70 % des acteurs de l’immunité se trouvent dans les intestins. La protection des tissus et du système circulatoire contre la contamination par des micro-organismes, des antigènes et des allergènes est assurée par la barrière intestinale et par le microbiote, permettant ainsi d’assurer la santé et le bien-être [5].

Une histoire d’équilibre

De plus en plus de données suggèrent aujourd’hui que le mode de vie et l’alimentation peuvent avoir un impact sur le microbiote intestinal.

Au cours de la vie, la santé du microbiote peut ne plus être optimale, comme par exemple au cours de la vieillesse ; il devient moins efficace et peut présenter des déséquilibres [2].Si on parle de symbiose quand le microbiote fonctionne normalement, on parle de dysbiose lors des déséquilibres du microbiote (liée à l’âge, à la prise de médicaments, à l’environnement, à la maladie etc…) De nombreuses études en cours explorent le lien entre cette dysbiose du microbiote intestinal et des maladies inflammatoires ou neurodégénératives comme la maladie d’Alzheimer [1] et éventuellement les cancers. Par exemple, la perturbation du microbiote intestinal serait associée aux maladies inflammatoires de l’intestin [3] ou au développement de l’obésité [3,7].

Les trois principaux facteurs d’influence ayant l’impact le plus fort sur le microbiote intestinal sont :

  • Les conditions de naissance et les habitudes des premiers temps de la vie (accouchement, alimentation, soins aux nourrissons) qui conditionne l’installation et l’équilibre de ce microbiote [8]
  • Le régime alimentaire
  • L’environnement et les expositions potentielles à des produits chimiques ou à des médicaments (comme les antibiotiques) [8]

Comment prendre soin de son microbiote ?

Le régime alimentaire peut avoir un impact important sur le microbiote intestinal : une alimentation équilibrée associée à un mode de vie sain est probablement le meilleur moyen de contribuer à la santé intestinale.

Les types d’aliments conseillés pour prendre soin de notre intestin sont les suivants :

  • Les laits fermentés tels que les yaourts [9,10] : ils apportent de nombreuses bactéries lactiques vivantes dans le tube digestif. Une fois qu’elles atteignent l’intestin, ces bactéries soutiennent les microbes vivants qui le traversent, du moins à court terme. Selon les chercheurs, les bactéries lactiques peuvent moduler l’environnement intestinal, améliorer la perméabilité de l’intestin et réduire les enzymes potentiellement dangereuses produites par d’autres bactéries. Les aliments fermentés tels que le kombucha, le kimchi et la choucroute : ils permettent de renouveler les bonnes bactéries intestinales.
  • Les aliments riches en fibres alimentaires, tels que les fruits, les légumineuses, les légumes ou les céréales [11].

Pour en savoir plus:


Quelques références :
[1] de J R De-Paula, V., Forlenza, A. S., & Forlenza, O. V. (2018). Relevance of gutmicrobiota in cognition, behaviour and Alzheimer’s disease. Pharmacological research
[2] Tout sur notre microbiote intestinal
[3] Guinane, C. M., & Cotter, P. D. (2013). Role of the gut microbiota in health and chronic gastrointestinal disease: understanding a hidden metabolic organ. Therapeutic advances in gastroenterology  
[4] C. Landman, E. Quévrain, Le microbiote intestinal : description, rôle et implication physiopathologique, La Revue de Médecine Interne, 2016
[5] Hollister EB et al. Structure and function of the healthy pre-adolescent pediatric gut microbiome. Microbiome. 2015;3:36. 
[6] Bienenstock, J. et al., Microbiota and the gut–brain axis , August 2015, Vol 73(8), pp. 28-31
[7] Patterson, E., Ryan, P. M., Cryan, J. F., Dinan, T. G., Ross, R. P., Fitzgerald, G. F., & Stanton, C. (2016). Gut microbiota, obesity and diabetes. Postgraduate medical journal
[8] Goulet O et al, Paediatricians play a key role in preventing early harmful events that could permanently influence the development of the gut microbiota in childhood, Acta Pædiatrica 2019 108, pp. 1942–1954
[9] Hill D, Sugrue I, Arendt E et al. Recent advances in microbial fermentation for dairy and health. F1000Res. 2017;6:751
[10] Donovan M and Rao G. Health benefits of yogurt among infants and toddlers aged 4 to 24 months: a systematic review. Nutr Rev 2019;77(7): 478-486
[11] Korczak R, Kamil A, Fleige L, Donovan SM, Slavin JL. Dietary fiber and digestive health in children. Nutr Rev. 2017 Apr 1;75(4):241-259